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芽孢桿菌，細菌的一科，能形成芽孢（內生孢子）的桿菌或球菌。包括芽孢桿菌屬、芽孢乳桿菌屬、梭菌屬、脫硫腸狀菌屬和芽孢八疊球菌屬等。它們對外界有害因子抵抗力強，分布廣，存在于土壤、水、空氣以及動物腸道等處。芽孢桿菌（桿菌科的一屬細菌。
絕大多數是一個菌體僅形成一個芽孢芽孢位于菌體內，為革蘭氏陽性菌。內含DNA、RNA、可能與 DNA相聯系的特異芽孢蛋白質以及合成蛋白質和產生能量的系統。
凝結芽孢桿菌還具有以下多重藥理作用：1.預防術后腸功能紊亂，促進術后排氣2.治療病毒性腹瀉3.治療腹瀉型腸易激綜合征、潰瘍性結腸炎4.防治抗生素相關性腹瀉及偽膜性腸炎5.肝硬化等慢性肝病的聯合治療6.聯合三聯方根除幽門螺桿菌7.防治手足口病、新生兒黃疸的防治、防治小兒濕疹8.治療細菌性陰道炎9.消除放化療對腸道菌群和腸粘膜的破壞等。10.Z后強調，凝結芽孢桿菌是唯一具有保水潤腸作用，快速恢復腸道菌群平衡的益生菌。
芽孢桿菌對腸道不良環境的抵抗
動物的腸道內存在諸多不良的環境，如低pH值的胃酸、高濃度的膽鹽、相對厭氧的環境等，這些環境不利于微生態制劑發揮作用。因此如何有效抵御這些不良環境的影響，是芽孢桿菌在動物體內發揮作用的前提。
芽孢在動物腸道中的萌發
另一方面，芽孢在不同試驗動物腸道中的保留特性差異很大。在禽類中的定植時間要顯著高于哺乳動物。
